蚌埠高新区1994年4月经安徽省人民政府批准成立，1995年5月启动建设，2010年11月被国务院批准为国家高新技术产业开发区，是国家级科技兴贸出口创新基地、国家新型工业化（硅基新材料）产业示范基地、国家级汽车零部件出口基地、国家级滤清器产业基地。2009年，蚌埠高新创业服务中心被科技部评为国家级创业服务中心，为皖北地区唯一的国家级孵化器。2011年，高新区管委会被中央文明委授予第三批“全国文明单位”，是全国唯一获此荣誉的高新区管委会。2013年9月，市委市政府决定，蚌埠高新区整建制托管秦集镇和马城经开区，托管后，高新区总体规划用地面积达123平方公里，就业和居住人口约12万人。
近年来，高新区突出龙头带动，狠抓招商引资，不断加快产业集聚，引进了广东德豪润达、中集安瑞科大型压缩机生产基地等50多个亿元以上项目，其中10亿元以上龙头项目20多个。区内现有各类企业870多家；其中国家高新技术企业55家，来自美国、德国等十多个国家和地区的外商合作企业30家。
高新区现已形成了装备制造及汽车零部件、电子信息、新材料和新能源、生物医药等四大主导产业。以汽车起重机、改装车、消防车、大型精整设备制造、大型建材成套设备、大中型环保装备、养殖孵化设备、数控机床、压缩机、离心机等产品为主导的装备制造产业集群在全国具有一定的影响力。以中电41所、华益导电膜、德豪润达为龙头而形成的新型显示、LED、特色电子等几个方向的光电产业集聚初具规模。新材料产业安徽首文碳纤维公司碳纤维项目现已建成投产，填补了我国高端碳纤维产业化的空白。区内还拥有以金威、昊业滤清器为代表的全国最大的滤清器生产基地、全国最大的汽车空调电磁离合器和养殖孵化机生产基地以及世界最大的ITO导电膜玻璃生产基地。